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Supplementary Data

RNA Bioinformatics Jena

lncRNA

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lncRNA	PVA	PAL	RAE	EHE	ESP	HAR	RSI	RFE	MLY	DRO	PPA	MLU	MBR	MDA	EFU	MNA
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	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF	unmerged transcripts GTF
	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast	blast
A2ML1-AS1	1	1	-	-	-	1	1	-	-	-	1	1	1	1	1	1
ACAP2-IT1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1
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ANKRD10-IT1	-	-	-	-	-	1	1	1	-	1	-	1	1	-	1	1
ANP32A-IT1	-	-	1	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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ASAP1-IT2	-	1	-	-	-	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-
ASB16-AS1	-	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
ASH1L-AS1	-	-	-	-	1	2	2	1	-	2	1	1	1	1	1	1
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ATXN8OS	-	-	-	-	-	1	1	-	-	-	-	-	-	1	-	-
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BICRA-AS1	-	-	1	-	-	1	1	1	1	1	1	2	1	1	1	1
BIN3-IT1	1	1	1	1	1	1	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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CACNA1C-IT3	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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CACNA2D3-AS1	-	1	1	-	1	1	1	-	-	-	1	-	-	-	-	-
CADM2-AS1	-	1	-	-	-	-	-	-	1	-	-	1	1	-	-	-
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CAHM	-	-	-	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
CAMTA1-DT	1	1	1	-	1	1	1	-	-	1	-	-	-	-	-	-
CAMTA1-IT1	1	1	-	1	-	1	1	1	-	-	-	-	-	-	-	1
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CASC16	1	1	1	1	1	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1
CASC17	1	1	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	-
CASC18	2	2	1	-	1	2	2	2	-	1	1	2	2	1	2	2
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CASC22	-	-	-	1	2	2	2	2	1	-	-	1	-	1	1	2
CASC6	-	1	1	1	1	-	1	1	1	-	-	-	-	-	-	1
CASC9	1	1	1	1	1	1	1	1	2	1	-	2	2	2	2	2
CASK-AS1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	-	-	-	-	-	-
CATIP-AS1	-	-	1	-	1	1	2	1	-	-	-	-	-	-	1	1
CATIP-AS2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	-	-	1	1	1	-	1
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CCDC39-AS1	-	1	-	1	-	1	-	-	1	-	-	-	-	-	-	-
CCEPR	1	1	1	1	1	1	1	1	-	-	1	-	-	-	-	-
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CDC37L1-DT	1	1	1	-	-	-	-	-	2	-	-	-	-	-	-	-
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CEP83-DT	1	1	1	1	1	1	-	-	-	-	1	-	-	-	-	1
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CFTR-AS1	-	-	-	-	-	1	1	1	1	-	-	1	1	-	1	1
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CHMP1B-AS1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	1	-	1	1
CHRM3-AS1	-	-	-	-	-	1	1	-	1	1	1	-	-	-	-	-
CHRM3-AS2	1	1	1	1	1	2	-	2	1	1	1	-	-	-	-	-
CISTR	2	2	2	1	2	2	2	1	1	2	2	2	2	2	2	2
CKMT2-AS1	3	3	1	1	1	1	3	2	-	2	1	1	2	1	1	2
CLIP1-AS1	1	1	1	1	1	1	2	2	2	1	-	1	2	1	2	2
CLMAT3	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	-	1	1	1	1	1
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CLYBL-AS1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	-	-	-	1	1
CLYBL-AS2	-	-	-	-	-	-	1	1	-	-	1	1	1	1	1	-
CNOT10-AS1	-	-	-	-	-	-	1	1	1	1	-	-	-	-	-	-
CNTFR-AS1	2	3	3	4	3	3	3	4	1	3	4	2	2	1	1	3
CNTN4-AS1	-	-	-	-	-	1	1	1	-	-	-	-	-	-	-	-
COX10-AS1	4	3	3	3	3	3	5	5	1	3	2	2	2	2	1	2
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CPEB2-DT	2	1	2	-	3	3	3	-	-	3	-	1	1	1	2	-
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CSTF3-DT	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	-	-	-	1	1
CXXC5-AS1	-	1	-	-	1	-	-	-	-	1	-	-	-	1	1	1
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CYTOR	1	1	-	-	-	-	-	-	1	1	-	3	3	2	1	3
CYYR1-AS1	-	1	1	-	1	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
DAB1-AS1	2	2	2	2	2	1	2	2	1	1	2	1	1	1	2	2
DACT3-AS1	1	1	2	1	-	1	1	1	1	1	1	-	-	-	-	-
DANCR	1	1	-	-	1	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-
DAOA-AS1	1	1	-	-	1	-	1	-	1	-	-	-	-	-	-	1
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DBET	1	1	1	1	1	-	-	-	1	-	-	1	1	1	1	-
DCST1-AS1	-	-	-	-	-	2	2	1	-	1	1	-	-	-	1	-
DCTN1-AS1	-	-	1	1	-	1	1	1	1	1	1	-	-	-	1	1
DDX11-AS1	-	-	-	1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
DEPDC1-AS1	1	-	1	1	-	-	1	-	1	1	-	1	1	-	1	-
DGUOK-AS1	4	4	4	3	5	3	4	4	2	3	1	2	2	1	-	3
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DIO3OS	-	-	-	-	1	1	2	1	-	1	-	-	1	-	1	-
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DLEU2	3	2	2	4	2	5	6	7	3	2	5	3	2	2	1	3
DLEU7-AS1	2	2	2	1	2	2	2	1	1	-	-	-	-	1	-	2
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DLGAP1-AS3	1	-	-	1	-	1	1	1	1	1	-	-	-	-	-	1
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HYMAI	3	3	3	1	3	3	3	1	2	1	-	1	1	1	2	-
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IGF2BP2-AS1	1	1	1	1	1	2	1	1	2	1	2	1	1	1	1	2
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IL12A-AS1	1	2	3	2	3	1	3	1	-	2	1	1	2	-	-	-
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IL20RB-AS1	1	1	1	1	1	-	1	-	1	1	-	1	-	-	1	-
INE1	1	1	-	1	-	1	1	1	1	-	-	-	-	-	-	-
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SNHG17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	1	1	-	-
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